Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrstQ06666 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrstQ06666 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrstQ06666 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrstQ06666 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrstQ06666 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrstQ06666 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms