Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Sh3bp2Q06649 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Sh3bp2Q06649 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Sh3bp2Q06649 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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