Protein–RNA interactions for Protein: Q05A36

Mex3c, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mex3cQ05A36 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mex3cQ05A36 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms