Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoc2Q05020 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms