Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sox13Q04891 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox13Q04891 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms