Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smpd1Q04519 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smpd1Q04519 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smpd1Q04519 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smpd1Q04519 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smpd1Q04519 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smpd1Q04519 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Smpd1Q04519 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Smpd1Q04519 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Smpd1Q04519 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smpd1Q04519 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms