Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CkbQ04447 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CkbQ04447 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CkbQ04447 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CkbQ04447 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CkbQ04447 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CkbQ04447 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CkbQ04447 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CkbQ04447 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CkbQ04447 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CkbQ04447 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CkbQ04447 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CkbQ04447 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CkbQ04447 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CkbQ04447 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CkbQ04447 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CkbQ04447 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CkbQ04447 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CkbQ04447 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CkbQ04447 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CkbQ04447 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CkbQ04447 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CkbQ04447 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CkbQ04447 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CkbQ04447 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CkbQ04447 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CkbQ04447 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CkbQ04447 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CkbQ04447 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CkbQ04447 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CkbQ04447 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CkbQ04447 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CkbQ04447 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CkbQ04447 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CkbQ04447 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CkbQ04447 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CkbQ04447 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CkbQ04447 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CkbQ04447 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CkbQ04447 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms