Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms