Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms