Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb4Q02738 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms