Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GscQ02591 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GscQ02591 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GscQ02591 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GscQ02591 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GscQ02591 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GscQ02591 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GscQ02591 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GscQ02591 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GscQ02591 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GscQ02591 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GscQ02591 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GscQ02591 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GscQ02591 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GscQ02591 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GscQ02591 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GscQ02591 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GscQ02591 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GscQ02591 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GscQ02591 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GscQ02591 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GscQ02591 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GscQ02591 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GscQ02591 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GscQ02591 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GscQ02591 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GscQ02591 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GscQ02591 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GscQ02591 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GscQ02591 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GscQ02591 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GscQ02591 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GscQ02591 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GscQ02591 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GscQ02591 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GscQ02591 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GscQ02591 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GscQ02591 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GscQ02591 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GscQ02591 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GscQ02591 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GscQ02591 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GscQ02591 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GscQ02591 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GscQ02591 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GscQ02591 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GscQ02591 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GscQ02591 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GscQ02591 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GscQ02591 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GscQ02591 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GscQ02591 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GscQ02591 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GscQ02591 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GscQ02591 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GscQ02591 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GscQ02591 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GscQ02591 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GscQ02591 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GscQ02591 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GscQ02591 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GscQ02591 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GscQ02591 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GscQ02591 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GscQ02591 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GscQ02591 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GscQ02591 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GscQ02591 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GscQ02591 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GscQ02591 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GscQ02591 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GscQ02591 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GscQ02591 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GscQ02591 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GscQ02591 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GscQ02591 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GscQ02591 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GscQ02591 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GscQ02591 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GscQ02591 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GscQ02591 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GscQ02591 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GscQ02591 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GscQ02591 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GscQ02591 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GscQ02591 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GscQ02591 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GscQ02591 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GscQ02591 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GscQ02591 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GscQ02591 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GscQ02591 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GscQ02591 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GscQ02591 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GscQ02591 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GscQ02591 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GscQ02591 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GscQ02591 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GscQ02591 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GscQ02591 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms