Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ascl1Q02067 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms