Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gbp1Q01514 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms