Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gja5Q01231 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja5Q01231 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja5Q01231 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja5Q01231 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja5Q01231 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja5Q01231 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja5Q01231 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja5Q01231 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja5Q01231 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja5Q01231 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja5Q01231 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja5Q01231 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja5Q01231 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja5Q01231 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja5Q01231 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja5Q01231 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gja5Q01231 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms