Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Col1a2Q01149 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms