Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pde1bQ01065 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pde1bQ01065 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms