Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoa1Q00623 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms