Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scn1bP97952 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn1bP97952 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms