Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitx2P97474 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms