Protein–RNA interactions for Protein: P97458

Prop1, Homeobox protein prophet of Pit-1, mousemouse

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prop1P97458 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prop1P97458 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prop1P97458 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prop1P97458 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prop1P97458 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prop1P97458 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prop1P97458 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prop1P97458 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prop1P97458 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Prop1P97458 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prop1P97458 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prop1P97458 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prop1P97458 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Prop1P97458 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prop1P97458 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prop1P97458 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Prop1P97458 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prop1P97458 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prop1P97458 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prop1P97458 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prop1P97458 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prop1P97458 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prop1P97458 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Prop1P97458 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prop1P97458 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prop1P97458 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prop1P97458 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Prop1P97458 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Prop1P97458 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Prop1P97458 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prop1P97458 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prop1P97458 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prop1P97458 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prop1P97458 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prop1P97458 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prop1P97458 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prop1P97458 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Prop1P97458 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Prop1P97458 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prop1P97458 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Prop1P97458 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prop1P97458 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Prop1P97458 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prop1P97458 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prop1P97458 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prop1P97458 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prop1P97458 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prop1P97458 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prop1P97458 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prop1P97458 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prop1P97458 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prop1P97458 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prop1P97458 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prop1P97458 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prop1P97458 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prop1P97458 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prop1P97458 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prop1P97458 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prop1P97458 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prop1P97458 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prop1P97458 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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