Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim43bP86448 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim43bP86448 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim43bP86448 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim43bP86448 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim43bP86448 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim43bP86448 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim43bP86448 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim43bP86448 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim43bP86448 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim43bP86448 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim43bP86448 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim43bP86448 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim43bP86448 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim43bP86448 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim43bP86448 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim43bP86448 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim43bP86448 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim43bP86448 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim43bP86448 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim43bP86448 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim43bP86448 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim43bP86448 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim43bP86448 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim43bP86448 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim43bP86448 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim43bP86448 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim43bP86448 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim43bP86448 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim43bP86448 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim43bP86448 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim43bP86448 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim43bP86448 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim43bP86448 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms