Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms