Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arf1P84078 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Arf1P84078 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf1P84078 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Arf1P84078 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arf1P84078 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arf1P84078 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arf1P84078 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arf1P84078 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms