Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gabpb2P81069 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gabpb2P81069 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabpb2P81069 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabpb2P81069 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabpb2P81069 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabpb2P81069 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabpb2P81069 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabpb2P81069 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabpb2P81069 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabpb2P81069 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabpb2P81069 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabpb2P81069 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabpb2P81069 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabpb2P81069 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabpb2P81069 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabpb2P81069 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabpb2P81069 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabpb2P81069 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabpb2P81069 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabpb2P81069 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabpb2P81069 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabpb2P81069 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabpb2P81069 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabpb2P81069 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabpb2P81069 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabpb2P81069 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabpb2P81069 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabpb2P81069 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabpb2P81069 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabpb2P81069 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabpb2P81069 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabpb2P81069 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabpb2P81069 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabpb2P81069 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabpb2P81069 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabpb2P81069 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabpb2P81069 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabpb2P81069 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabpb2P81069 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabpb2P81069 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabpb2P81069 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms