Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx1P80205 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx1P80205 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx1P80205 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx1P80205 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx1P80205 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx1P80205 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Otx1P80205 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Otx1P80205 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otx1P80205 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms