Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ufd1P70362 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ufd1P70362 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ufd1P70362 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ufd1P70362 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ufd1P70362 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ufd1P70362 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ufd1P70362 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ufd1P70362 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufd1P70362 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms