Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rad54lP70270 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rad54lP70270 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rad54lP70270 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rad54lP70270 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rad54lP70270 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rad54lP70270 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rad54lP70270 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rad54lP70270 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rad54lP70270 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rad54lP70270 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rad54lP70270 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad54lP70270 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad54lP70270 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad54lP70270 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad54lP70270 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad54lP70270 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad54lP70270 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad54lP70270 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad54lP70270 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad54lP70270 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad54lP70270 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad54lP70270 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad54lP70270 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad54lP70270 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad54lP70270 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad54lP70270 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad54lP70270 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad54lP70270 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad54lP70270 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rad54lP70270 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rad54lP70270 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rad54lP70270 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms