Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Hoxd13P70217 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Hoxd13P70217 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Hoxd13P70217 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Hoxd13P70217 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Hoxd13P70217 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Hoxd13P70217 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Hoxd13P70217 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd13P70217 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms