Protein–RNA interactions for Protein: P63013

Prrx1, Paired mesoderm homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx1P63013 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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