Protein–RNA interactions for Protein: P62270

Rps18, 40S ribosomal protein S18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps18P62270 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps18P62270 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps18P62270 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps18P62270 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps18P62270 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps18P62270 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps18P62270 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps18P62270 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms