Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms