Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copz1P61924 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copz1P61924 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copz1P61924 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copz1P61924 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Copz1P61924 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Copz1P61924 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copz1P61924 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copz1P61924 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copz1P61924 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copz1P61924 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copz1P61924 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copz1P61924 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copz1P61924 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copz1P61924 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Copz1P61924 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Copz1P61924 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Copz1P61924 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Copz1P61924 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copz1P61924 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copz1P61924 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copz1P61924 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copz1P61924 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copz1P61924 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copz1P61924 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copz1P61924 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copz1P61924 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copz1P61924 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copz1P61924 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copz1P61924 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copz1P61924 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copz1P61924 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copz1P61924 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copz1P61924 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copz1P61924 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copz1P61924 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copz1P61924 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copz1P61924 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copz1P61924 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Copz1P61924 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copz1P61924 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copz1P61924 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copz1P61924 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms