Protein–RNA interactions for Protein: P60843

Eif4a1, Eukaryotic initiation factor 4A-I, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif4a1P60843 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Eif4a1P60843 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Eif4a1P60843 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Eif4a1P60843 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eif4a1P60843 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eif4a1P60843 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eif4a1P60843 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eif4a1P60843 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eif4a1P60843 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eif4a1P60843 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eif4a1P60843 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eif4a1P60843 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eif4a1P60843 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Eif4a1P60843 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eif4a1P60843 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eif4a1P60843 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eif4a1P60843 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Eif4a1P60843 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Eif4a1P60843 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eif4a1P60843 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eif4a1P60843 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eif4a1P60843 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Eif4a1P60843 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Eif4a1P60843 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Eif4a1P60843 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Eif4a1P60843 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Eif4a1P60843 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Eif4a1P60843 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eif4a1P60843 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms