Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nphp4P59240 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nphp4P59240 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nphp4P59240 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms