Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtnsP57757 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtnsP57757 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtnsP57757 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CtnsP57757 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtnsP57757 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtnsP57757 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CtnsP57757 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtnsP57757 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms