Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms