Protein–RNA interactions for Protein: P56475

Gabrr1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrr1P56475 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrr1P56475 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrr1P56475 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms