Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Usp5P56399 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp5P56399 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp5P56399 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp5P56399 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp5P56399 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Usp5P56399 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp5P56399 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp5P56399 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms