Protein–RNA interactions for Protein: P56390

Cks2, Cyclin-dependent kinases regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cks2P56390 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cks2P56390 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cks2P56390 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cks2P56390 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cks2P56390 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cks2P56390 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cks2P56390 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cks2P56390 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cks2P56390 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cks2P56390 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cks2P56390 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cks2P56390 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cks2P56390 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cks2P56390 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cks2P56390 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cks2P56390 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cks2P56390 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cks2P56390 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cks2P56390 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cks2P56390 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cks2P56390 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cks2P56390 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cks2P56390 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cks2P56390 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cks2P56390 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cks2P56390 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cks2P56390 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cks2P56390 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cks2P56390 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cks2P56390 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cks2P56390 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cks2P56390 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cks2P56390 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cks2P56390 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cks2P56390 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cks2P56390 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cks2P56390 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cks2P56390 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cks2P56390 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cks2P56390 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cks2P56390 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cks2P56390 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cks2P56390 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cks2P56390 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cks2P56390 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cks2P56390 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cks2P56390 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cks2P56390 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms