Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp1P55194 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
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Sh3bp1P55194 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Sh3bp1P55194 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Sh3bp1P55194 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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