Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GemP55041 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GemP55041 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GemP55041 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GemP55041 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GemP55041 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GemP55041 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GemP55041 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GemP55041 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GemP55041 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GemP55041 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GemP55041 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GemP55041 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GemP55041 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GemP55041 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GemP55041 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GemP55041 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GemP55041 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GemP55041 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GemP55041 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GemP55041 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GemP55041 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GemP55041 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GemP55041 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GemP55041 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GemP55041 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GemP55041 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GemP55041 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GemP55041 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GemP55041 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GemP55041 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GemP55041 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GemP55041 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GemP55041 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GemP55041 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GemP55041 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GemP55041 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GemP55041 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GemP55041 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GemP55041 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GemP55041 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GemP55041 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GemP55041 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GemP55041 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GemP55041 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GemP55041 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GemP55041 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GemP55041 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GemP55041 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GemP55041 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GemP55041 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GemP55041 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GemP55041 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GemP55041 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GemP55041 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GemP55041 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GemP55041 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GemP55041 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GemP55041 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GemP55041 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GemP55041 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GemP55041 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GemP55041 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GemP55041 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GemP55041 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GemP55041 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GemP55041 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GemP55041 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GemP55041 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GemP55041 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GemP55041 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GemP55041 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GemP55041 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GemP55041 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GemP55041 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GemP55041 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GemP55041 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GemP55041 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GemP55041 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GemP55041 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GemP55041 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GemP55041 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GemP55041 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GemP55041 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GemP55041 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GemP55041 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GemP55041 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GemP55041 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GemP55041 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GemP55041 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GemP55041 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GemP55041 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GemP55041 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GemP55041 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GemP55041 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GemP55041 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GemP55041 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GemP55041 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GemP55041 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GemP55041 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms