Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Faf1P54731 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Faf1P54731 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Faf1P54731 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Faf1P54731 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Faf1P54731 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms