Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fdft1P53798 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms