Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SftpbP50405 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SftpbP50405 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SftpbP50405 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SftpbP50405 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SftpbP50405 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SftpbP50405 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SftpbP50405 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SftpbP50405 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms