Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SftpdP50404 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SftpdP50404 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SftpdP50404 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SftpdP50404 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SftpdP50404 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SftpdP50404 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SftpdP50404 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SftpdP50404 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SftpdP50404 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SftpdP50404 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SftpdP50404 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms