Protein–RNA interactions for Protein: P48986

Neurod6, Neurogenic differentiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod6P48986 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Neurod6P48986 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Neurod6P48986 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Neurod6P48986 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Neurod6P48986 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Neurod6P48986 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Neurod6P48986 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Neurod6P48986 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Neurod6P48986 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Neurod6P48986 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Neurod6P48986 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Neurod6P48986 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Neurod6P48986 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Neurod6P48986 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Neurod6P48986 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Neurod6P48986 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Neurod6P48986 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Neurod6P48986 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Neurod6P48986 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Neurod6P48986 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Neurod6P48986 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Neurod6P48986 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Neurod6P48986 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Neurod6P48986 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Neurod6P48986 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Neurod6P48986 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Neurod6P48986 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Neurod6P48986 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Neurod6P48986 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Neurod6P48986 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Neurod6P48986 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Neurod6P48986 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Neurod6P48986 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Neurod6P48986 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Neurod6P48986 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Neurod6P48986 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Neurod6P48986 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms