Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptx3P48759 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms