Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl5P47962 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms