Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zic1P46684 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zic1P46684 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Zic1P46684 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zic1P46684 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zic1P46684 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zic1P46684 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zic1P46684 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms