Protein–RNA interactions for Protein: P46660

Ina, Alpha-internexin, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InaP46660 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
InaP46660 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
InaP46660 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
InaP46660 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
InaP46660 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
InaP46660 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
InaP46660 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
InaP46660 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
InaP46660 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
InaP46660 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
InaP46660 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
InaP46660 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
InaP46660 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
InaP46660 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
InaP46660 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
InaP46660 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
InaP46660 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
InaP46660 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
InaP46660 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
InaP46660 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
InaP46660 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
InaP46660 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
InaP46660 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
InaP46660 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
InaP46660 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
InaP46660 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
InaP46660 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
InaP46660 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
InaP46660 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
InaP46660 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
InaP46660 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
InaP46660 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
InaP46660 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
InaP46660 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
InaP46660 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
InaP46660 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
InaP46660 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
InaP46660 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
InaP46660 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
InaP46660 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
InaP46660 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
InaP46660 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
InaP46660 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
InaP46660 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
InaP46660 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
InaP46660 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
InaP46660 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
InaP46660 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
InaP46660 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
InaP46660 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
InaP46660 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
InaP46660 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
InaP46660 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
InaP46660 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
InaP46660 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
InaP46660 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
InaP46660 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
InaP46660 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
InaP46660 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
InaP46660 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
InaP46660 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
InaP46660 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
InaP46660 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
InaP46660 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
InaP46660 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
InaP46660 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
InaP46660 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
InaP46660 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
InaP46660 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
InaP46660 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
InaP46660 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
InaP46660 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
InaP46660 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
InaP46660 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
InaP46660 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
InaP46660 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
InaP46660 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
InaP46660 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
InaP46660 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
InaP46660 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
InaP46660 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
InaP46660 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
InaP46660 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
InaP46660 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
InaP46660 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
InaP46660 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
InaP46660 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
InaP46660 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
InaP46660 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
InaP46660 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
InaP46660 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
InaP46660 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
InaP46660 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
InaP46660 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
InaP46660 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
InaP46660 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
InaP46660 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
InaP46660 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
InaP46660 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
InaP46660 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms